Основная польза от летучих мышей - уничтожение ими по ночам вредных насекомых. За ночь зверек съедает такое их количество, что составляет более половины массы его собственного тела. Подсчитано, что летучие мыши из пещер Карлсбад в штате Нью - Мексико истребляют за одну летнюю ночь несколько тонн насекомых.

Многие растения тропиков опыляются нектароядными летучими мышами. Поедая плоды, рукокрылые распространяют семена и тем самым способствуют восстановлению леса. Помет летучих мышей (гуано) служит ценным удобрением; из одних только пещер Карлсбад его добыто более 100 000 т. 

Однако, они могут не только уничтожать вредных насекомых и опылять растения, но и, по мнению ученых, помочь человеку справиться с такой опасной болезнью, как бешенство, которое может привести, в ряде случаев, к летальному исходу.

Исследователи установили, что воздействие вируса бешенства на летучих мышей отличается от последствий поражения им остальных млекопитающих. Во-первых, инфекция не приводит к увеличению смертности в колониях этих рукокрылых, а провоцирует у них защитную иммунную реакцию.

Исследователи также определили примерное время репродукции вируса и период, в течение которого пораженная бешенством мышь сохраняет способность заражать людей и других животных. Последний показатель не превышает пяти дней. Ученые считают результаты своей работы крайне важными. По их мнению, не исключено, что дальнейшее изучение механизма защиты летучих мышей позволит исключить опасность инфицирования этим вирусом людей. 

Летучие мыши являются важным регулятором численности многих насекомых, принося определенную пользу сельскому хозяйству.